Tiene como misión estudiar problemas ambientales de interés y escala local o regional, además de contribuir con información relevante relacionada con prioridades de alcance global, en un enfoque integrado, desde la química ambiental, la eco-toxicología y la toxicología ambiental, junto a la evaluación de riesgos e impacto ambiental.

Por otra parte, realiza una intensa actividad en la formación de Recursos Humanos a través de tesis de doctorado y maestría, prácticas de experiencia laboral de estudiantes de grado y el dictado de cursos de grado o postgrado. Adicionalmente, existe una muy activa participación en tareas de extensión a la comunidad y el sector productivo y de gestión, en proyectos relacionados con salud y medio ambiente, educación ambiental, además de la intervención en causas por litigios ambientales, prestación de servicios a terceros, apoyo técnico en comisiones de calidad, entre otros.